智因东方哪些患者需要做基因检测
2018新春伊始,智因东方为奋战在儿科遗传病诊断战线上的临床医生、遗传学家奉上一篇《NATURE REVIEWS GENETICS》新近刊登的综述《Paediatric genomics: diagnosing rare disease in children》(PMID: 29398702)的完整译文
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基因检测
基因测序
儿科基因组学:在儿童罕见病诊断中的应用
1、很多罕见病都累及儿童,且这些罕见病患儿的发病情形多墙绅褡孛数是由于潜在的遗传因素所导致的。然而,利用当前的馆嗳髀姐知识和技术对这些罕见病进行分子诊断仍是一项挑战。儿科基因组学通过将新一代测序技术,特别是全外显子组测序(WES)和全基因组测序(WGS)技术,应用到该领域的研究及临床实践中以攻克这项挑战,目前其尚处于一个发展不甚成熟但进展非常迅速的阶段。这种复杂多学科的方法,结合不断增加的人群遗传变异数据,已经大幅提高了致病基因的发现率,并促进了儿科罕见疾病的诊断。
传统的基因检测
1、在过去,临床遗传学主要依赖两种类型的基因检测:高度集中于分子区域的高分辨率的单基因检测和全基因组低分辨率的细胞遗传学检测 (FIG. 2a)。在单基因分子检测中,根据患者的临床表现选择特定基因进行Sanger测序或基因分型。通过这种检测得到确诊的概率,取决于医师正确识别病症的潜在遗传病因,并选择正确的检测方案。
现代基因检测技术
1、NGS技术能够对多个基因, 进行大规模的平行测序,这使得临床遗传学 发生了革命性的变化。临床医生现在可以要求同时对多个基因、甚至全外显子组或全基因组进行测序,而非仅仅选择对单个基因或单一类型的变异进行检测。这种高分辨率的全基因组检测方法结合了单分子检测和全基因组细胞遗传学检测的优点(FIG.2a)。
基于新一代测序技术的诊断检测
1、NGS用于临床诊断的策略有很多种,根据测序靶标区域数量和类型的不同而不同。靶标检测方法,包括对完整的单个基因进行测序,例如之酡箔挝棍前已经对单独变异进行过基因分型的疾病;对疾病特异性基因进行测序,检测范围从2至>2,000个基因中组成的不同大小的基因检测panel;对目前与单基因疾病有关的约4,000个基因的所有外显子进行测序,这也被称为临床外显子组或孟德尔组(Mendeliome)。