tbtools的使用方法

1、序列处理工具在组学数据分析中，一个常见的问题是，如果基于给定的基因列表，从序列集合中提取序列这一功能，不仅可以用于提取基因的全序列，也可以基于用户指定的染色体区间，批量提取对应的区间序列。当然，只要起始坐标大于终止坐标，用户可以直接获得正链的反向互补序列，事实上即反链5-3的序列。查看序列文件中的序列个数，获得其中所有序列的ID和统计信息，有时候会有不少用户，尤其是做进化分析的朋友，Fasta Stater这一功能可以帮助用户快速统计Fasta文件中每个序列的信息，包括ID，长度，描述信息，GC含量等。

3、基因功能分析工具组学数据分析中，我们总是可以获得一些基因列表，如差异表达基因，进化过程中的正选择基因，缺失的基因等。快速了解这些基因是否明显偏好于某一功能，如成花？低温响应？转录调控？基因的功能富集分析，是一个常见的操作。TBtools中提供基于超几何分布的富集分析操作，包括GO富集分析和KEGG通路富集分析。