如何可以更全面地了解10x单细胞ATAC-seq
1、10x单细胞ATAC-seq实验流程首先,将转座酶加入制备好的单细胞核悬液进行反应。随后,利用8通道的微流体双十字交叉系统将含Barcode的Gel Beads、细胞核和酶的混合物、油三者结合形成GEMs。在GEMs中,凝胶珠溶解释放大量barcode序列,DNA延伸带上barcode序列,并进行线性扩增。最后,进行illumina的文库构建。
2、10x单细胞ATAC-seq可以有哪些方向的应用从具体分析内容来讲,单细胞ATAT测序:● 可在单细胞水平揭示细胞核内染色质可接近性的差异;● 可鉴定细胞类型特异的转录因子,深入研究转录调控网络;● 可预测转录因子结合位点,推测染色质调控活性。从生物学研究大方向分,单细胞ATAC测序:● 可应用于干细胞或发育生物学的研究,绘制驱动细胞分化的调控网络;● 适用于免疫学研究,可揭示T细胞激活、分化等过程的表观调控机制;● 可挖掘用于肿瘤亚型鉴定的新型分子标记,研究肿瘤发生相关的重要通路;● 可应用于神经科学,鉴定复杂的神经细胞亚型,探究神经相关疾病的分子机制。
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