基因进化树构建(MEGA6.0)
1、在将上述基因序列保存好了之后,开始构建基因进化树。首先在网上寻找到MEGA6.0的软件,并将其下载下来,如图所示文件夹。
2、打开MEGA6的文件夹,找到MEGA6.06 exe,运行软件,弹出如图所示。
3、点击表头的Align,点击edit/Build Alignment,弹出如下对话框。点击ok。
4、完成上述步骤后,弹出如下对话框,选择DNA,弹出如下对话框。
5、接着对下面对话框的表头那一排,点击edit,点击Insert Sequence From File,弹出如下对话框,
6、将你之间准备好的基因序列单独建一个文件夹,在上一步完成后,将文件夹打开进去,会发现是空的,这时候需要你把文件类型改成txt格式,就能显示你的序列文档了。
7、将文件夹里面的基因序列文档全部选中,点击打开。如图所示。这时候你点击序列查看一下序列首尾两端是否对齐,如果出现载体没连接的情况,首位段序列不对齐,就可以把不对齐的序列去掉。去掉方法,选中序列某一段,点击X就行了。
8、可将前面的序列名称改一下,等下好构建基因计划树。改好后如图所示:
9、接着点击表头的W,将序列点击一下(选中序列),点击Align DNA,点击ok,结束后如图所示。
10、点击Data,点击Phylogenetic Analysis,弹出如下所示对话框,点击yes,结束后返回到第一个界面。如图所示。
11、点击Analysis,点击Phylogeny,点击Construct/Test Neighbor-Joining Tree。。。弹出如下对话框,然后点击yes,
12、点击Compute,弹出如下基因进化树比对结果。点击Image,点击Copy to clipboard,即可将图片复制粘贴到WPS文档。
声明:本网站引用、摘录或转载内容仅供网站访问者交流或参考,不代表本站立场,如存在版权或非法内容,请联系站长删除,联系邮箱:site.kefu@qq.com。
阅读量:43
阅读量:30
阅读量:56
阅读量:29
阅读量:34