如何一步GEO实现差异基因分析

1、一步GEO1、进入一步GEO界面，输入GSE编号（我们以GSE36001为例），点击查询按钮，如图1、2所示：

2、选择分组 本案例Normal bone作为对照组CTR，而Osteosarcoma cell line作为疾病组DIS，点击CTR按钮，再点击具体的数据行，或者括选，之后同理选择DIS按钮，选择好分组后点击提交按钮，会自动完成GEOname和group，如图3、4所示，再点击运行按钮：

3、差异基因结果 提交运行后，稍等一会就出结果，如图5所示，打开结果中的html报告，如下图6：

4、一步GEO优点省去了数据预处理的复杂操作和修改多组分组信息的步骤，方便快捷实现两两对比差异分析。